Чтение .mat файлов в Python
Заголовок: Проблема с чтением двоичных файлов MATLAB .mat в Python
Содержание:
Возможно ли читать двоичные .mat файлы MATLAB в Python?
Я заметил, что SciPy предполагает поддержку для чтения .mat файлов, но у меня не получается это сделать. Я установил версию SciPy 0.7.0, но не могу найти метод loadmat()
.
Пожалуйста, помогите разобраться в этой проблеме!
5 ответ(ов)
Вам нужно импортировать модуль scipy.io
, чтобы использовать функцию loadmat
. Вот пример кода:
import scipy.io
mat = scipy.io.loadmat('file.mat')
Убедитесь, что файл file.mat
находится в текущем рабочем каталоге или укажите полный путь к файлу.
Для начала сохраните файл .mat следующим образом:
save('test.mat', '-v7')
После этого в Python используйте обычную функцию loadmat
:
import scipy.io as sio
test = sio.loadmat('test.mat')
Таким образом, вы сможете успешно загрузить файл в Python.
Существует отличная библиотека для этой задачи под названием pymatreader
.
Просто выполните следующие шаги:
- Установите пакет:
pip install pymatreader
- Импортируйте нужную функцию из этого пакета:
from pymatreader import read_mat
- Используйте функцию для чтения MATLAB структуры:
data = read_mat('matlab_struct.mat')
- Используйте
data.keys()
, чтобы найти, где на самом деле хранятся данные.
- Ключи обычно выглядят как:
dict_keys(['__header__', '__version__', '__globals__', 'data_opp'])
. В данном случаеdata_opp
будет тем самым ключом, который содержит данные. Имя этого ключа, конечно, может быть другим в различных файлах.
- Последний шаг - создайте свой DataFrame:
my_df = pd.DataFrame(data['data_opp'])
Вот и все 😃
Для чтения файла в формате MAT используйте следующий код:
import scipy.io
mat = scipy.io.loadmat(file_name)
После загрузки MAT-файла вы можете проверить тип переменной mat
с помощью следующего кода:
print(type(mat))
# ВЫВОД - <class 'dict'>
В этом случае mat
представляет собой словарь (dict
), в котором ключи — это переменные MATLAB, а значения — это объекты, присвоенные этим переменным.
Чтобы загрузить файл формата MAT в DataFrame библиотеки pandas с помощью Python, можно использовать библиотеку scipy
для чтения файла и преобразования данных. Вот пример кода, который вы можете использовать:
import scipy.io as sio
import pandas as pd
# Загрузка .mat-файла
mat = sio.loadmat('file.mat') # Замените 'file.mat' на имя вашего файла
mdata = mat['myVar'] # Здесь 'myVar' - это переменная в файле .mat
# Извлечение данных из переменной
ndata = {n: mdata[n][0, 0] for n in mdata.dtype.names}
# Определение колонок, которые следует включить в DataFrame
Columns = [n for n, v in ndata.items() if v.size == 1]
# Создание словаря для DataFrame
d = {c: ndata[c][0] for c in Columns}
# Создание DataFrame из словаря
df = pd.DataFrame.from_dict(d)
# Отображение DataFrame
display(df) # или print(df)
В этом коде мы сначала загружаем .mat файл с помощью функции loadmat
из scipy.io
. Затем мы получаем переменную myVar
, которую хотим преобразовать в DataFrame. Сбор данных осуществляется через понимание словарей, где мы выбираем только те колонки, которые содержат по одному элементу. После этого создаём DataFrame и отображаем его.
Обратите внимание, что вам может потребоваться установить библиотеки scipy
и pandas
, если они у вас еще не установлены, с помощью команды pip install scipy pandas
.
UnicodeDecodeError: Кодек 'charmap' не может декодировать байт X в позиции Y: символ отображается как <неопределённый>
Правильный способ записи строки в файл?
Сохранение списка в файл с помощью Python с учетом переносов строк
Как открыть несколько файлов с помощью "with open" в Python?
Вывод строки в текстовый файл